Tilde Simensen slog till efter bara tolv sekunder i förlängningen och blev matchhjälte med sitt 2-1-mål.
Inget av lagen fick in något mål i varken första eller andra perioden.
Troja/Ljungby tog ledningen först efter tio minuters spel i tredje perioden, genom Alva Johansson.
17.27 in i tredje perioden slog Meija Lind till på pass av Linnea Horn och kvitterade för Linköping 2.
Laget avgjorde matchen med -1.48 kvar att spela genom Tilde Simensen. Simensen fullbordade därmed Linköping 2:s vändning.
Det här var Troja/Ljungbys andra uddamålsförlust den här säsongen. Det var även Linköping 2:s andra uddamålsseger.
Resultatet innebär att Troja/Ljungby ligger kvar på femte plats och Linköping 2 sist, på sjunde plats i tabellen.
Troja/Ljungby tar sig an Rögle i nästa match hemma söndag 10 december 12.00. Linköping 2 möter Karlskrona hemma fredag 8 december 19.00.
