Marek Hrivik stod för Leksands avgörande mål med bara 52 sekunder kvar av tredje perioden.
Segern var Leksands fjärde på de senaste fem matcherna.
För Leksand gör resultatet att man nu ligger på sjätte plats i tabellen, medan Malmö är på tionde plats.
Malmö möter Brynäs i nästa match borta tisdag 12 januari 19.00. Leksand möter samma dag Rögle borta.
